Program studi Fisika Universitas Nasional telah berdiri sejak tahun 1990. Saat ini program studi Fisika telah terakreditasi B oleh BANPT dan memiliki dua bidang peminatan yaitu Fisika Medik dan Geofisika. Program studi Fisika telah tergabung dalam AIPFMI (Aliansi Institusi Pendidikan Fisika Medik Indonesia) sejak tahun 2019 dan telah bekerja sama dengan RSUD Pasar Minggu, RSPAD Gatot Subroto, Poltekkes Jakarta II, dan BPFK dalam pelaksanaan pendidikan.